Жители Бурятии хорошо помнят Наговицына. Он возглавлял республику десять лет — с 2007 по 2017 год, после чего почти восемь лет представлял регион в Совете Федерации. В начале своего правления Наговицын обещал сделать из Бурятии бездотационный регион. Уверял, что республика сможет развиваться за счет промышленности, привлечения инвестиций и масштабных инфраструктурных проектов.
Однако к концу его правления Бурятия оставалась одним самых дотационных регионов России, а многие крупные проекты Наговицына, которые он называл «стратегическими», так и не были завершены. Например, особая экономическая зона «Байкальская гавань», на которую из бюджета потратили миллиарды рублей, так и не стала центром туризма, как задумывалось.
Вместо экономического подъема годы Наговицына у власти запомнились жителям Бурятии многочисленными коррупционными скандалами. Одним из самых обсуждаемых стала история со «служебной квартирой» и мебелью.
Когда Наговицын приехал в республику, власти выделили ему элитное жилье в Улан-Удэ, которое тот обставил за счет бюджета. Позже в квартире поселилась сестра главы— уроженка Узбекистана Ольга Зайцева, которой брат помог получить российское гражданство и устроиться в Республиканскую службу государственного стройнадзора. При этом необходимого образования и стажа у нее не было, сообщали журналисты «Новой Бурятии».
Спустя несколько лет Зайцева решила переехать в Обнинск в Калужской области и вывезла с собой всю дорогостоящую мебель из служебной квартиры. Чтобы скрыть пропажу, в администрации составили акт о прорыве трубы и «потопе», который якобы испортил мебель. Однако позже выяснилось, что никакого потопа не было, а часть мебели следователи обнаружили в ходе обысков в новом доме Ольги Зайцевой.
Кроме того, в 2013 году для Наговицына возвели трехэтажный «гостевой дом» в поселке Сотниково. На его строительство из бюджета потратили 61 миллион рублей, но в документах проект был оформлен как «реконструкция». После публикаций местных журналистов Следственный комитет возбудил дело о нецелевом расходовании средств. Однако фигурантом дела стал не глава республики, директор хозяйственно-транспортного комплекса администрации Александр Сучков. Самого Наговицына лишь вызвали на допрос, хотя у следователей, как утверждала «Новая Бурятия», были документы с его личными указаниями по отделке и дизайну дома.
Уже став сенатором в Совете Федерации, Наговицын не перестал вредить жителям региона, которым когда-то руководил. Он стал автором законопроекта, разрешающего сплошные вырубки больных и погибших деревьев вокруг Байкала, и активно его продвигал вместе с нынешним главой Бурятии Алексеем Цыденовым.
Инициатива вызвала резкую критику и возмущение у экологов и жителей региона, которые опасались, что под предлогом вырубки больных начнут вырубать и здоровые деревья — и продавать их заграницу. Даже глава СПЧ Валерий Фадеев, а также ученые РАН предупреждали, что принятие законопроекта может нанести непоправимый вред экосистеме Байкала. После протестов жителей депутаты решили не рассматривать законопроект на ближайшей весенней сессии, заявив, что документ требует доработки.